sábado, 25 de julio de 2020

TÉCNICA AUTOMATIZADA DE PIROSECUENCIACIÓN EN ANEMIA DE CELULAS FALCIFORMES

Debido a que las mutaciones HbS y HbC están separadas por un solo nucleótido, no es fácil desarrollar sondas específicas para PCR en tiempo real, por lo que se describe una técnica de pirosecuenciación (PyS) que se desarrolló para confirmar el genotipo SCD. La técnica se validó usando la secuenciación de Sanger del gen HBB.

Pirosecuenciación: La técnica de pirosecuenciación es una herramienta altamente confiable para la determinación de pequeñas regiones dentro de los genes de la globina, y tiene la ventaja de ser una técnica relativamente simple. Además es más rápida y se asocia con un menor costo de operación en comparación con otras metodologías de secuenciación. Las secuencias de cebadores se diseñan utilizando de la siguiente manera: Adelante 5’ATTGCTTACATTTGCTTCTGACAC3’, Inversa 5’ACCAACTTCATCCACGTTCAC3. La PCR se realizó utiliza 100 ng / μL de ADN de acuerdo con el protocolo y el producto  usando la secuencia de cebador 5'CATGGTGCATCTGACT3 '.

Secuenciación Sanger: Utiliza la técnica de secuenciación de Sanger para la determinación de mutaciones de talasemia β. La PCR se utilizó para amplificar un fragmento de 101 pares de bases que cubren la región de codificación del gen Beta Globin, que tiene aproximadamente 619 pares de bases, utilizando la siguiente secuencia de cebadores: (P1) 5’-TCCTAAGCCAGTGCCAGAAG-3’y el cebador aguas abajo (P5) 5’-TCATTCGTCTGTTTCCCATTC3’.

 Referencias Bibliográficas:

sábado, 18 de julio de 2020

APLICACIÓN DE PCR PARA ESTUDIO DEL GEN BETA-GLOBINA EN LA ANEMIA DE CÉLULAS FALCIFORMES


Prueba PCR para diagnóstico de Anemia de Células Falciformes
Tema (T):
PCR para diagnóstico de Anemia de Células Falciformes
Objetivo (O):
El objetivo es estudiar las secuencias de nucleótidos y el estudio molecular del gen de la β-globina en pacientes saudíes con anemia falciforme, e identificar las variantes genéticas asociadas con las manifestaciones clínicas.
Tipo de Muestra Biológica (M):
Se extrajeron diez ml de sangre venosa y se distribuyeron a dos tubos (cada uno con 5 ml) de ácido etilendiamina tetraacético (EDTA). 
Secuencia o Gen a amplificar (G):

Tipo de Ácido Nucleíco a ser extraído (AN):
  El ADN genómico de los pacientes.
Extracción (Ex)
 El ADN se extrajo usando un kit de purificación de gel Qiagen, de acuerdo con las instrucciones del fabricante.
Tipo de PCR (PCR):
Se usa RT-PCR, se uso cebadores de PCR. Treinta y cinco ciclos de PCR
Visualiación (V):
El gel amplificado se visualizó y fotografió bajo luz UV (Bio-Rad Gel Doc 2000 Imaging System).

Refencias Bibliográficas