sábado, 1 de agosto de 2020

Prueba de tamizaje y una confirmatoria para Anemia Falciforme


 
Prueba de tamizaje

Diagnóstico Prenatal para Anemia Falciforme
(PCR-ARMS)
Se utiliza muestras de líquido amniótico de parejas en riesgo de anemia falciforme para la detección de los alelos βS. Se realiza extracción de ADN, mediante el método de precipitación salina con 20mL de líquido amniótico recolectado en un tubo estéril. Para detectar la presencia de los alelos βS se utiliza el método de Reacción en Cadena de la Polimerasa-Amplificación Refractaria de Mutaciones Específicas (PCR-ARMS),utilizando un juego de cebadores como control interno de amplificación y un cebador común para amplificar los alelos A, S y C. La amplificación se realizó en un termociclador e incluye un varios ciclos de desnaturalización y una extensión final. Para realizar la corrida electroforética se mezcla 25 μL del producto de PCR obtenido con 5 μL de bromofenol azul (BFA) como frente de corrida que fueron aplicados en un gel de agarosa al 2 %, teñido con bromuro de tidio y finalmente, los fragmentos se visualizan al exponer a luz ultravioleta el gel de agarosa teñido con bromuro de tidio.

Prueba de diagnóstico 

Electroforesis de hemoglobina con pH alcalino 
La electroforesis a pH alcalino permite determinar el tipo de hemoglobina predominante. en el caso de Anemia Falciforme con genotipo homocigoto la única banda electroforética presente o de mayor intensidad corresponde a la hemoglobina S (HbS), con ausencia total o escasa presencia de HbA normal. En el estado heterocigoto las bandas electroforéticas de las hemoglobinas A y HbS suelen tener la misma intensidad. 

Referencias Bibliográficas



sábado, 25 de julio de 2020

TÉCNICA AUTOMATIZADA DE PIROSECUENCIACIÓN EN ANEMIA DE CELULAS FALCIFORMES

Debido a que las mutaciones HbS y HbC están separadas por un solo nucleótido, no es fácil desarrollar sondas específicas para PCR en tiempo real, por lo que se describe una técnica de pirosecuenciación (PyS) que se desarrolló para confirmar el genotipo SCD. La técnica se validó usando la secuenciación de Sanger del gen HBB.

Pirosecuenciación: La técnica de pirosecuenciación es una herramienta altamente confiable para la determinación de pequeñas regiones dentro de los genes de la globina, y tiene la ventaja de ser una técnica relativamente simple. Además es más rápida y se asocia con un menor costo de operación en comparación con otras metodologías de secuenciación. Las secuencias de cebadores se diseñan utilizando de la siguiente manera: Adelante 5’ATTGCTTACATTTGCTTCTGACAC3’, Inversa 5’ACCAACTTCATCCACGTTCAC3. La PCR se realizó utiliza 100 ng / μL de ADN de acuerdo con el protocolo y el producto  usando la secuencia de cebador 5'CATGGTGCATCTGACT3 '.

Secuenciación Sanger: Utiliza la técnica de secuenciación de Sanger para la determinación de mutaciones de talasemia β. La PCR se utilizó para amplificar un fragmento de 101 pares de bases que cubren la región de codificación del gen Beta Globin, que tiene aproximadamente 619 pares de bases, utilizando la siguiente secuencia de cebadores: (P1) 5’-TCCTAAGCCAGTGCCAGAAG-3’y el cebador aguas abajo (P5) 5’-TCATTCGTCTGTTTCCCATTC3’.

 Referencias Bibliográficas:

sábado, 18 de julio de 2020

APLICACIÓN DE PCR PARA ESTUDIO DEL GEN BETA-GLOBINA EN LA ANEMIA DE CÉLULAS FALCIFORMES


Prueba PCR para diagnóstico de Anemia de Células Falciformes
Tema (T):
PCR para diagnóstico de Anemia de Células Falciformes
Objetivo (O):
El objetivo es estudiar las secuencias de nucleótidos y el estudio molecular del gen de la β-globina en pacientes saudíes con anemia falciforme, e identificar las variantes genéticas asociadas con las manifestaciones clínicas.
Tipo de Muestra Biológica (M):
Se extrajeron diez ml de sangre venosa y se distribuyeron a dos tubos (cada uno con 5 ml) de ácido etilendiamina tetraacético (EDTA). 
Secuencia o Gen a amplificar (G):

Tipo de Ácido Nucleíco a ser extraído (AN):
  El ADN genómico de los pacientes.
Extracción (Ex)
 El ADN se extrajo usando un kit de purificación de gel Qiagen, de acuerdo con las instrucciones del fabricante.
Tipo de PCR (PCR):
Se usa RT-PCR, se uso cebadores de PCR. Treinta y cinco ciclos de PCR
Visualiación (V):
El gel amplificado se visualizó y fotografió bajo luz UV (Bio-Rad Gel Doc 2000 Imaging System).

Refencias Bibliográficas